Mặc dù máy tính công nghiệp và bộ điều khiển trung tâm rất giống nhau, nhưng vẫn có một số khác biệt:

Sử dụng khác nhau: Máy tính điều khiển công nghiệp thường được sử dụng để điều khiển tự động hóa và thu thập và xử lý dữ liệu trong các hệ thống điều khiển công nghiệp;Bộ điều khiển trung tâm thường được sử dụng cho hệ thống điều khiển trung tâm của các tòa nhà lớn hoặc nhà thông minh, chịu trách nhiệm kiểm soát hoạt động của toàn bộ thiết bị hoặc hệ thống.

Khả năng xử lý khác nhau: Do nhu cầu xử lý dữ liệu thời gian thực, máy tính điều khiển công nghiệp đòi hỏi khả năng xử lý cao hơn và tốc độ phản hồi nhanh hơn; Tuy nhiên,bộ điều khiển trung tâm thường không cần xử lý một lượng lớn dữ liệu và kiểm soát thời gian thực, và công suất xử lý của nó tương đối thấp.

Khả năng mở rộng khác nhau: Máy tính điều khiển công nghiệp thường có khả năng mở rộng mạnh hơn và có thể thêm nhiều khe cắm, giao diện và mô-đun khi cần thiết; Bộ điều khiển trung tâm thường tương đối cố định,có khả năng mở rộng yếu, và hiếm khi có cơ hội được nâng cấp.

Môi trường làm việc khác nhau: Máy tính công nghiệp thường được sử dụng trong môi trường công nghiệp khắc nghiệt đòi hỏi độ bền và độ tin cậy cao hơn,trong khi các bộ điều khiển trung tâm thường được sử dụng trong môi trường ổn định như nhà hoặc văn phòng.

Cấu hình phần cứng khác nhau: Máy tính điều khiển công nghiệp thường có các yêu cầu cấu hình phần cứng nghiêm ngặt hơn, đòi hỏi các tính năng như kháng nhiễu điện từ,phòng chống bụi, chống nước và chống va chạm; Tuy nhiên, bộ điều khiển trung tâm thường không yêu cầu các tính năng này.